Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype

Pengenalan Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) adalah mikroorganisma yang sedang muncul dan berkembang di seluruh dunia dan bakal menimbulkan ancaman kepada tatacara penjagaan kesihatan. Gen yang boleh dipindah milik telah menyebabkan kerintangan kepada banyak kumpulan antibiotik yang mem...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Din@Mohamad, Nurul Izzah Md
Format: Thesis
Language:English
Published: 2017
Subjects:
Online Access:http://eprints.usm.my/45473/1/Dr.%20Nurul%20Izzah-24%20pages.pdf
http://eprints.usm.my/45473/
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id my.usm.eprints.45473
record_format eprints
spelling my.usm.eprints.45473 http://eprints.usm.my/45473/ Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype Din@Mohamad, Nurul Izzah Md R Medicine (General) Pengenalan Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) adalah mikroorganisma yang sedang muncul dan berkembang di seluruh dunia dan bakal menimbulkan ancaman kepada tatacara penjagaan kesihatan. Gen yang boleh dipindah milik telah menyebabkan kerintangan kepada banyak kumpulan antibiotik yang membawa kepada kesukaran rawatan dan kadar kematian yang tinggi. CRE adalah biasanya berkaitan dengan penjagaan kesihatan. Jangkitan invasif dengan CRE telah dikaitkan dengan kes kematian yang tinggi. Mengenal pasti pesakit dengan CRE positif adalah penting untuk menghalang penyebaran organisma berdaya tahan ini yang berpotensi untuk menyebabkan jangkitan. Oleh yang demikian, kajian ini dijalankan untuk mengetahui signifikasi dan gen bagi CRE berserta perilaku klinikal setiap pesakit yang positif CRE di HUSM. Tatacara kajian Kajian ini dijalankan di Hospital Universiti Sains Malaysia bermula Ogos 2013 sehingga Disember 2015. CRE positif telah dikenal pasti daripada Makmal Mikrobiologi Perubatan & Parasitologi. CRE yang telah di kenalpasti kemudian diuji untuk gen bla-NDM. Semua yang negatif bla-NDM kemudiannya akan diuji untuk gen bla-IMP menggunakan teknik PCR. Rekod pesakit di semak dan kemudiannya data yang dikumpulkan dianalisa menggunakan perisian SPSS Statistik versi 22. Analisa secara deskriptif dijalankan bagi kedua-dua kategori danpemboleh ubah bebas berangka dan seterusnya diukur menggunakan frekuensi, peratusan dan median interquatile range (IQR) secara respektif. Bagi kategori analisa data, Fisher exact test and Pearson Chi-square test digunakan. Keputusan Antara 136 CRE sampel daripada 114 pesakit, 60 (44.1%) adalah daripada sapuan rektum diikuti oleh urin [25 (18.4%)], cecair badan [19 (14.0%)], darah [15 (11.0%)], kahak [9 (6.6%)] dan sapuan /tisu [8 (5.9%)]. Organisma yang paling banyak adalah Klebsiella pneumoniae (n= 126, 92.7%), diikuti oleh Enterobacter aerogenes (n=4, 2.9%), Enterobacter cloacae dan Klebsiella ozanae [dua (1.5%)]. Satu (0.7%) sampel adalah Citrobacter freundii dan Escherichia coli. Genotip yang paling banyak adalah bla-NDM1 (n=112, 82.4%) dan hanya satu (0.7%) bla-IMP. Kebanyakan daripada pesakit, 81(71.1%) telah dikoloni oleh CRE, 23 (20.2%) telah dijangkiti dan sepuluh (8.8%) pesakit adalah telah dikoloni dan kemudiannya dijangkiti. CRE kebanyakannya terjadi di kalangan pesakit yang sudah mempunyai penyakit lain sebelum ini (n=89, 78.1%). Darah tinggi (53.5%), kencing manis (43.9%) dan penyakit buah pinggang kronik (36.0%) adalah merupakan penyakit yang paling banyak ditemui. Kebanyakan pesakit mempunyai kemasukan ke hospital secara berpanjangan (n=90, 78.9%), kemasukan ke ICU (n=69, 60.5%) dan sejarah kemasukan ke hospital (n=70, 61.4%) semasa CRE di kesan. Jangkitan yang kerapkali berlaku adalah jangkitan saluran darah (n=14, 35.0%) dan pneumonia (n=14, 35.0%). CRE-Jangkitan saluran darah (p=0.002) dan CRE-pneumonia (p<0.001) adalah sangat berkait dengan kematian.Kesimpulan Hasil daripada kajian yang telah dijalankan, adalah didapati kebanyakan daripada sampel CRE adalah Klebsiella pneumoniae dan kebanyakannya daripada pesakit yang telah di koloni CRE. Gen bla-NDM adalah gen yang paling banyak dikesan dalam sampel CRE. Lebih 50% daripada pesakit yang positif CRE adalah terdiri daripada mereka yang telah dimasukkan ke hospital secara berpanjangan, kemasukan ke ICU dan pernah dimasukkan ke hospital. Sebagai tambahan, CRE-jangkitan saluran darah and CRE-pneumonia adalah jangkitan yang paling banyak ditemui dan kebiasaannya mengakibatkan kematian. 2017 Thesis NonPeerReviewed application/pdf en http://eprints.usm.my/45473/1/Dr.%20Nurul%20Izzah-24%20pages.pdf Din@Mohamad, Nurul Izzah Md (2017) Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype. Masters thesis, Universiti Sains Malaysia.
institution Universiti Sains Malaysia
building Hamzah Sendut Library
collection Institutional Repository
continent Asia
country Malaysia
content_provider Universiti Sains Malaysia
content_source USM Institutional Repository
url_provider http://eprints.usm.my/
language English
topic R Medicine (General)
spellingShingle R Medicine (General)
Din@Mohamad, Nurul Izzah Md
Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype
description Pengenalan Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) adalah mikroorganisma yang sedang muncul dan berkembang di seluruh dunia dan bakal menimbulkan ancaman kepada tatacara penjagaan kesihatan. Gen yang boleh dipindah milik telah menyebabkan kerintangan kepada banyak kumpulan antibiotik yang membawa kepada kesukaran rawatan dan kadar kematian yang tinggi. CRE adalah biasanya berkaitan dengan penjagaan kesihatan. Jangkitan invasif dengan CRE telah dikaitkan dengan kes kematian yang tinggi. Mengenal pasti pesakit dengan CRE positif adalah penting untuk menghalang penyebaran organisma berdaya tahan ini yang berpotensi untuk menyebabkan jangkitan. Oleh yang demikian, kajian ini dijalankan untuk mengetahui signifikasi dan gen bagi CRE berserta perilaku klinikal setiap pesakit yang positif CRE di HUSM. Tatacara kajian Kajian ini dijalankan di Hospital Universiti Sains Malaysia bermula Ogos 2013 sehingga Disember 2015. CRE positif telah dikenal pasti daripada Makmal Mikrobiologi Perubatan & Parasitologi. CRE yang telah di kenalpasti kemudian diuji untuk gen bla-NDM. Semua yang negatif bla-NDM kemudiannya akan diuji untuk gen bla-IMP menggunakan teknik PCR. Rekod pesakit di semak dan kemudiannya data yang dikumpulkan dianalisa menggunakan perisian SPSS Statistik versi 22. Analisa secara deskriptif dijalankan bagi kedua-dua kategori danpemboleh ubah bebas berangka dan seterusnya diukur menggunakan frekuensi, peratusan dan median interquatile range (IQR) secara respektif. Bagi kategori analisa data, Fisher exact test and Pearson Chi-square test digunakan. Keputusan Antara 136 CRE sampel daripada 114 pesakit, 60 (44.1%) adalah daripada sapuan rektum diikuti oleh urin [25 (18.4%)], cecair badan [19 (14.0%)], darah [15 (11.0%)], kahak [9 (6.6%)] dan sapuan /tisu [8 (5.9%)]. Organisma yang paling banyak adalah Klebsiella pneumoniae (n= 126, 92.7%), diikuti oleh Enterobacter aerogenes (n=4, 2.9%), Enterobacter cloacae dan Klebsiella ozanae [dua (1.5%)]. Satu (0.7%) sampel adalah Citrobacter freundii dan Escherichia coli. Genotip yang paling banyak adalah bla-NDM1 (n=112, 82.4%) dan hanya satu (0.7%) bla-IMP. Kebanyakan daripada pesakit, 81(71.1%) telah dikoloni oleh CRE, 23 (20.2%) telah dijangkiti dan sepuluh (8.8%) pesakit adalah telah dikoloni dan kemudiannya dijangkiti. CRE kebanyakannya terjadi di kalangan pesakit yang sudah mempunyai penyakit lain sebelum ini (n=89, 78.1%). Darah tinggi (53.5%), kencing manis (43.9%) dan penyakit buah pinggang kronik (36.0%) adalah merupakan penyakit yang paling banyak ditemui. Kebanyakan pesakit mempunyai kemasukan ke hospital secara berpanjangan (n=90, 78.9%), kemasukan ke ICU (n=69, 60.5%) dan sejarah kemasukan ke hospital (n=70, 61.4%) semasa CRE di kesan. Jangkitan yang kerapkali berlaku adalah jangkitan saluran darah (n=14, 35.0%) dan pneumonia (n=14, 35.0%). CRE-Jangkitan saluran darah (p=0.002) dan CRE-pneumonia (p<0.001) adalah sangat berkait dengan kematian.Kesimpulan Hasil daripada kajian yang telah dijalankan, adalah didapati kebanyakan daripada sampel CRE adalah Klebsiella pneumoniae dan kebanyakannya daripada pesakit yang telah di koloni CRE. Gen bla-NDM adalah gen yang paling banyak dikesan dalam sampel CRE. Lebih 50% daripada pesakit yang positif CRE adalah terdiri daripada mereka yang telah dimasukkan ke hospital secara berpanjangan, kemasukan ke ICU dan pernah dimasukkan ke hospital. Sebagai tambahan, CRE-jangkitan saluran darah and CRE-pneumonia adalah jangkitan yang paling banyak ditemui dan kebiasaannya mengakibatkan kematian.
format Thesis
author Din@Mohamad, Nurul Izzah Md
author_facet Din@Mohamad, Nurul Izzah Md
author_sort Din@Mohamad, Nurul Izzah Md
title Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype
title_short Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype
title_full Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype
title_fullStr Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype
title_full_unstemmed Clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (CRE) and its genotype
title_sort clinical characteristics of patients with positive carbapenem resistant enterobacteriaceae (cre) and its genotype
publishDate 2017
url http://eprints.usm.my/45473/1/Dr.%20Nurul%20Izzah-24%20pages.pdf
http://eprints.usm.my/45473/
_version_ 1681490167410458624
score 13.159267